在南海爭端日趨緊張之際，菲律賓總統阿基諾三世周二對日本進行了訪問，據法新社報道，日本首相安倍在會晤時向阿基諾三世表示，雙方在應對地區緊張局勢方面有着緊密的合作，他和阿基諾總統一樣，都認同履行國際法對仲裁領土糾紛的重要性。安倍在會談中強調：“日本與菲律賓有着共同的普遍價值。希望進一步發展戰略夥伴關係。” 阿基諾對此表示，希望此次會談能成為“再次激活兩國戰略關係的契機”。阿基諾指出，當前地區安全面臨考驗。
共同社也報道說，安倍晉三周二與菲律賓總統阿基諾舉行了會談。雙方確認，在中國活躍開展海洋活動的東海及南海“法治”理念至 關重要。兩國首腦還就加強包括災害救援在內的安全領域合作達成了共識。安倍還就正在推進的修改憲法解釋以解禁集體自衛權一事進行了說明，安倍在會談中表示“已制定防衛裝備轉移三原則作為積極和平主義的舉措，正在研究集體自衛權與憲法間的關係”，並強調“和平國家的原則不會改變，也會向菲律賓認真說明”。
阿基諾則就中菲主權之爭闡述了菲律賓政府的方針，表示菲方希望根據《聯合國海洋法公約》在國際仲裁法庭解決問題。日本首相安倍對此回應稱，“強烈支持根據法律解決爭端的努力”。雙方還就進一步加強經濟關係達成了共識。這是兩國首腦第四次舉行會談，上次是在阿基諾三世訪日的去年12月。華爾街日報的文章分析說，日本和菲律賓認為中國在東中國海（中國稱東海）和南中國海（中國稱南海）表現出了愈加堅定的領土主張，日菲兩國目前正努力應對。阿基諾表示，他相信安倍晉三擴大日本軍事作用的努力將有益於地區穩定。他還承諾，將深化菲律賓與日本在安全和經濟領域的雙邊戰略夥伴關係。
阿基諾還就日本政府解禁集體自衛權表示支持。他表示，日本政府一旦獲得授權支援其他國家，“良善的國家”都能因此而受惠，特別是在集體自衛的領域上。安倍在前不久的新加坡香格里拉論壇上曾經提到日本願幫助區域盟國"確保海洋及空域安全"。他表示，日本及其夥伴國美國做好與東盟加強安全合作的準備，以推動和平。"日本有意扮演比至今為止更主動積極的角色，推動亞洲及世界和平。” 華爾街日報指出，為擴大日本在本地區的作用，安倍晉三一直在謀求重新解釋日本的《和平憲法》，以便允許日本自衛隊行使“集體自衛”權，也就是允許日本自衛隊參與美國等盟國的防禦行動，即便日本自己並未受到襲擊。美國政府對安倍此舉表示歡迎，幾個與中國有領土爭端的東南亞國家似乎也願意看到日本與美國加強安全聯繫。但也有人批評說，安倍晉三沒有經過周密論證就過快地推動變革。另外，安倍晉三此舉也引發了中國和韓國的疑慮。
有關中國與菲律賓在南海的爭端，菲律賓已經於2013年1月向國際仲裁法庭提出訴訟。北京則表示表示不接受菲方啟動的仲裁進程，拒絕接受仲裁法庭的管轄。中國政府的對策是堅決反對把南海爭端國際化，希望通過雙邊對話來解決分歧，這樣便可以維持自己的優勢地位，阻止其他國家聯合起來對抗北京。
據菲律賓媒體報道，菲律賓一名外交官稱，日本已承諾提供10艘巡邏艇給菲律賓，以強化菲保衛領海的能力。第一批三艘船隻將於明年交付菲律賓，而其餘七艘將於2016年初抵菲。菲律賓駐東京大使館臨時代辦阿蘇奎說，“日本支持菲律賓的政策是為了提高我方領海權意識、監管權能力。為此，日本政府通過援助給菲律賓海岸巡邏隊10艘巡邏艇來支持菲律賓政府，”阿蘇奎說多功能反應艦艇是為了加強菲海岸巡邏隊的能力。除巡邏艇外，阿蘇奎說，日本也將給菲提供援助以改善菲律賓海岸巡邏隊的遠程通訊系統。阿蘇奎還表示，日本也將繼續為海岸巡邏隊提供人員培訓，包括安全和海洋環境保護，航行安全領域等所有能增強菲律賓實力，提升其執行主權權利及根據國際法享有的海事司法管轄權能力的培訓。