國安局透露基地組織兩大巨頭曾多次入境台灣
台灣中國時報集團旗下的《時報周刊》5月6日最新一期報道，幕後策畫911紐約恐怖襲擊的兩大巨頭紮瓦赫里和穆罕默德，曾分別在1995年和2001年到過台灣。穆罕默德曾揚言威嚇，指稱拉登一旦遭到殺害或被捕，基地組織將在歐洲引爆一枚核彈。
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美國紐約2001年9月11日遭到由基地組織策畫的恐怖襲擊，而兩人是在這次恐襲之前，入境台灣的。
《時報周刊》引述台灣國家安全局的消息指出，當局一直都將兩人曾經訪台一事保持機密，以免台灣成為襲擊的對象。消息人士接受周刊訪問時說，由於台灣與美國和其他國家維持經常性的情報交流，「我么充分掌握了上述兩人在台灣的行程，一直對他們嚴密監視，直至他們離開台灣為止。」
紮瓦赫里與拉登乃長期戰友，有消息指在拉登死後，他將成為基地組織的領袖。紮瓦赫里同時也是埃及伊斯蘭聖戰第二個、也是最後一個王侯。據稱他是一個執業醫生，身兼拉登的謀臣和私人醫生。紮瓦赫里可操流利阿拉伯語、英語及法語，對伊斯蘭教義和歷史有豐富的研究心得。
《時報周刊》報道，紮瓦赫里在1995年與1997年之間，曾到過台灣3次，國安局表示，停留時間最長的一次是一個星期，國安局全程掌握了他的行蹤，以及與他見面的人，但基於國家機密為由，國安局並未透露這些人的身份。
報道又指出，紮瓦赫里在香港和馬來西亞的銀行，擁有為數約3000萬美元的戶口，相信是為基地組織募款而得的金錢，但並無任何跡象顯示他曾在台灣銀行開設戶口。
根據台灣國安局與外國的情報交流所得，在911襲擊之前，穆罕默德計畫在亞洲某處機場騎劫一架飛機，作為襲擊美國之用，而台灣的桃園機場據稱是他考慮的其中一個機場。
穆罕默德在2003年3月1日在巴基斯坦被捕，作為基地組織的成員，在科威特出生的穆罕默德目前正在美軍管治的關塔那摩拘留營接受調查，他被控的罪名包括謀殺多個無辜平民，如被定罪，將面臨死刑。
911調查委員會的報告同時指出，穆罕默德同時涉嫌與過去20年的多宗恐怖襲擊案件有關，除了紐約世貿中心雙子大廈之外，還包括印尼峇里島酒吧爆炸以及將《華爾街日報》記者佩爾砍頭等案。