官方強勢介入否定台大校長遴選結果引反彈義務律師團正面迎戰
台灣新上任的台獨教育部長吳昆茂上任不到一星期，立刻以最快速度決定，否決台大「校長遴選委員會」選出的新任校長管中閔的人事案，並要求台大重新辦理遴選。這是台獨陣營在角逐台灣學術界龍頭「國立台灣大學」校長寶座的一大勝利，但幾乎也是台灣民主政治的熄燈號。
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教育部駁回遴選結果的理由是，「有經濟法律上重大利益未迴避的適法疑慮，台大未善盡應盡責任，基本誠信未被彰顯，甚至被含糊以對」。但教育部所指的「台哥大」獨立董事問題，及違法在大陸大學兼職問題，早已經由台大校方及遴選委員會二度公開確認「並無疑義」。
教育部的粗魯蠻幹，已經引起返彈。台灣的「國立大學院校協會」發表聲明支持台大校方的遴選作業和結果指出，國立大學校長遴選委員會，由各大學獨立推選五分之四的委員，與政府代表共同組成，來自大學外部的委員比例超過校內委員，顯示委員會並非屬於學校。遴選委員會是獲得大學完全授權的「社會公器」進行校長遴選。決定人選後送主管機關聘任，完成遴選程序。基於大學自治精神，政府不應干預遴選結果。
台灣大學也發表聲明指出，遴選委員會依法遴選出管中閔，一切合乎規定，對於教育部的決定「深感錯愕，並表達遺憾與強烈異議」。校方認為，教育部的決定，不僅不利於高等教育未來發展，也已經對於台灣的大學發展產生重大負面影響。
台大校長遴選委員會的聲明則表示，遴選過程中，戒慎遵守各項「迴避原則」及「利益衝突」規範；遴委會對於教育部所稱「重大行政瑕疵」，及要求「駁回管中閔台大校長資格，重新進行遴選」，完全無法接受。
中研院院士、香港城市大學校長郭位指出，政治霸凌高教，國際罕見，「政府較百年前的軍閥還等而下之」。
台灣文化部前部長、知名作家龍應台指出，這是一個台灣百年民主追求史上的里程碑，這樣的決定顯然是在總統蔡英文的許可，行政院長賴清德拍板下做成的，在他們身為政治人物的從政史上，留下一個紀錄，為一黨之私，他們破壞了「大學自主」的核心精神。
由於各界高度懷疑是高層政治人物在幕後操盤，台灣總統蔡英文面對媒體質疑時說，這是一個專業的決定，由教育部來處理，也應該尊重教育部的決定。行政院長賴清德不願響應；行政院發言人則說，如果府院介入，早就處理了，怎麼會拖這麼久。
本來應該在二月上任的台大校長當選人管中閔在個人臉書發文指出，這是台灣爭取大學自治的重大挫敗，教育部也將因違法踐踏大學自治而被加載史冊，他還說，「我們必將贏回大學自治，台灣大學也將因此屹立不搖」。
據了解，管中閔的義務律師團將把本案訴諸法律，到行政法庭，打行政訴訟，控告行政機關作為不當。