如果說申根區邊境線關閉僅用了幾天，那麼歐洲疫情日漸趨穩的同時，邊境重新開放各國各自為政，無法達成統一。
申根區的重要基礎之一便是人員自由流通制度。3月中旬面對新冠疫情，這項制度被暫時擱置，流通許可被縮減到最嚴格的範圍，只有家住在另外一國，邊境線工作者，貨物運輸工人，參與人道主義救援的醫護等特殊情況，才被允許出入境。嚴格的限制措施讓旅遊業受到重創。旅遊業創造的收入佔據歐洲GDP總量的10%，創造的工作崗位佔據就業12%。儘管歐洲委員會一直呼籲各國聯合協調，有序開放邊境，允許旅遊業部分重啟，但依舊枉然。就在德國與波蘭的公路出入境站點排起長長的車隊之際，通過法國轉火車入比利時再前往德國，則會在比利時被攔截。再比如5月5日起，波羅的海三國對彼此開放邊境，對外則繼續關閉。意大利也沒有等待其他申根區國家，率先宣布6月3日起，對歐盟遊客開放邊界。英國則在脫歐的混亂當中，派專機從波蘭接走了大約200名波蘭季節工人，前往英國務工。
唯一肯定的是，歐盟邊境對外關閉仍然將保持數周，甚至數個月。歐委會對邊境控制沒有決定權，只是“邀請”各國6月15日之前保持嚴格控制，但對於冰島，列支敦士登，挪威，瑞士等與歐盟緊密相連的歐洲國家，軟化限制。法國外交部長勒德里昂5月19日曾重申，“目前申根區之外能夠進入法國的，只有家住法國的法國公民”。擁有雙重國籍的境外生活的法國人，也並不在優先回國的選項之上。
嚴格意義上來講，歐盟成員國之間的往來並沒有被一刀切斷，而是進行了嚴格把控。但由於只有“緊急特殊情況”者才能通行，實際操作起來給很多家庭造成麻煩。另外，法國的農忙季節已經來臨，內政部希望儘快安排歐盟內部的季節性農民入境法國。
有關法國公民出境，政府表示從未下達禁令，不會禁止法國人出境，但他們是否能夠入境目的地國家，還要嚴密查看目的地國家的政策，以免被遣返。
入境歐盟之後的檢疫隔離政策，各國也各行其道。理論上來說，歐盟國公民入境法國不用隔離14天，但自從5月20日起，從歐盟外部迴流的法國公民則要在“自願的原則上”在家或者在選定的地點自我隔離。這已經招致境外法國人的極度不滿。另一個問題是，西班牙決定5月12起，對所有入境者實施隔離，法國對此表示不滿，認為政策應該是雙向的。不僅西班牙，意大利，波蘭，斯洛伐克，奧地利，捷克等的隔離政策都不同。
事實上，歐盟成員國的公民是否可以在邊境政策軟化之後出境游，仍然是個未知數，因為包括美國等大部分國家，仍然保持對歐洲人入境的禁令。加拿大，巴西，阿根廷，南非，肯尼亞，科特迪瓦，突尼斯，以色列，巴勒斯坦，俄羅斯，日本，泰國，印尼，澳大利亞，新西蘭等法國人青睞的傳統度假地，也都嚴格禁止法國人入境，除非情況特殊。另外一些國家則沒有對法國人關閉邊界，但幾乎停止了所有聯通法國的國際航班，例如印度，阿爾及利亞和摩洛哥。中國目前已經恢復了簽證簽發服務，但飛往中國的航班少之又少。
面對申根區內外的邊境管控混亂局面，法國外交部表示，預計在6月15日前後逐漸統一進行管控軟化。