六月份，加拿大總理國家安全及情報顧問喬迪·托馬斯 (Jody Thomas) 罕見地點名印度是外國干涉加拿大的主要來源之一，幾天後印度外交部長蘇傑生指責加拿大正為印度的“極端分子提供空間”。實施印太戰略半年來，加拿大視印度為其重要夥伴，關係日漸親密，但存在多年的錫克激進獨立運動問題再次發作，令相互走近的兩國互揭瘡疤。
6月1日喬迪·托馬斯在加拿大國會眾議院就惠靈頓-荷頓山選區議員和其他議員受恐嚇一事作證時指印度是外國干涉加拿大的首要來源國之一，加拿大新聞社報道說過去“渥太華公開點名的主要是專制國家”，但這一次喬迪·托馬斯說“當談論外國干涉和經濟安全時，國家行為者和代理人包括俄羅斯、伊朗、印度，問題最多當然是中國”。
卑斯大學全球事務學院兼職教授維娜·恩吉布拉（Vina Nadjibulla）認為托馬斯將印度與其他三個國家並列“打擊”，對加拿大與印度建立更緊密關係的努力構成了挑戰，但“這顯然與印度僑民社區和政治有關，儘管與印度的關係正迅速改善，但如果加拿大無視印度裔社區的政治問題，不僅是自欺欺人，還將產生重大影響”。
加新社指聯邦政府近年曾在內部文件中不點名警告印度在加拿大施加不當影響，例如去年由於加拿大發放學生簽證進展緩慢，印度學生激進運動利用的社交媒體可能會受到外國影響。加新社獲得一份2018年政府報告指和華裔一樣，印度裔加拿大人也面臨著“受外國政府公開或暗中影響的風險”，因為“合法宣傳和為促進外國經濟和政治利益而施加壓力的遊說之間的界限正變得越來越模糊”。另外前安全顧問丹尼爾·讓（Daniel Jean）認為印度政府中有人試圖讓杜魯多在2018 年訪問印度期間難堪，印度政府還多次向加拿大高層提出錫克教極端主義。由錫克人執掌黨鞭的加拿大新民黨則經常將印度列為外國干涉的來源，提醒渥太華應節制與新德里的關係以解決人權問題。
加新社還提及印度指責加拿大是干涉印度內政的幕後黑手，這涉及錫克教分離主義運動，包括1985年印度航空公司從多倫多飛往新德里的航班爆炸案。
在喬迪·托馬斯點名印度後，6月5日大多倫多地區印度裔重鎮布蘭普頓 （Brampton）舉行的5公里花車遊行中出現了錫克族保鏢刺殺前印度總理英迪拉·甘地的表演，以紀念她主導的鎮壓旁遮普錫克人獨立的軍事行動藍星行動 (Operation Blue Star) 39周年， 這一遊行驚動了新德里，隨後布蘭普頓市長辦公室發表聲明稱“警方已經看過視頻，認為這不構成仇恨犯罪”，並稱根據《加拿大權利和自由憲章》第2 條“加拿大人享有思想、信仰和言論自由的保障”。
6月9日，印度外交部長蘇傑生指責“加拿大一直在為哈利斯坦分子提供空間”，這對兩國關係不利，對加拿大不利”。他希望加拿大從歷史中吸取教訓，渥太華因為“投票政治”而給哈利斯坦分裂分子提供了空間。在回應加拿大國家安全顧問將印度描述為“外國干涉加拿大的主要來源”之一時，蘇傑生強調如果要指責，那也應該是印度指責加拿大。
加拿大駐印度高級專員卡梅倫·麥凱也強烈譴責遊行表演，“我對加拿大慶祝印度總理英迪拉·甘地遇刺感到震驚，加拿大應該沒有仇恨或美化暴力的容身之地”。